Это который лаборатория Наото? Ключ лежит на одном из этажей (на четвёртом вроде), в комнате за закрытой дверью. Ключ от двери находится то ли на последнем этаже, то ли на предпоследнем. То есть надо дойти до конца, взять ключ, вернуться обратно на тот этаж с закрытой дверью, взять ключ там и вернуться на последний этаж.
По крайней мере в Golden версии так. В простой думаю так же.